1877 年，日本爆发西南战争，熊本县厅为躲避战火，于2月19 日傍晚迁至御船町的万事通——林田能宽的故居（现池田活版印刷所附近）。
这就是“县厅遗址”的来历。
然而，县厅搬迁后不久就被萨摩军和前武士阶级包围，县厅工作人员们感到危险，为了保护公款和文件而逃离此地。
因此，“御船县厅”才两天就结束了它的使命。
之后，县厅在熊本县内各地辗转，最终于1877年4月16日重回熊本城内的原址。